بله، طبق قانون مالیات بر ارزش افزوده، هزینه حمل‌ونقل نیز در زمره خدمات مشمول مالیات قرار می‌گیرد. به این معنا که خدمات ارائه‌شده توسط شرکت‌های حمل‌ونقل اعم از درون‌شهری یا برون‌شهری، مشمول مالیات بر ارزش افزوده هستند و باید مالیات مربوط به آن در صورتحساب لحاظ گردد.
بر اساس ماده ۳ قانون مالیات بر ارزش افزوده، هر نوع عرضه کالا و ارائه خدمات در کشور که به‌صورت مستقیم یا غیرمستقیم انجام می‌گیرد، مشمول این مالیات است. بنابراین، هزینه حمل‌ونقل به‌عنوان بخشی از قیمت تمام‌شده کالا یا خدمت، مشمول ارزش افزوده بوده و باید در فرآیند ثبت بارنامه در سایت امور مالیاتی نیز لحاظ شود.

نکته مهم برای مودیان این است که مالیات پرداخت‌شده بابت هزینه حمل، در صورتی‌که به فعالیت‌های اقتصادی مشمول آن‌ها مربوط باشد، به‌عنوان اعتبار مالیاتی قابل کسر از مالیات خروجی خواهد بود. بنابراین نگهداری مستندات و ثبت دقیق بارنامه‌ها در سامانه mytax.gov.ir اهمیت دوچندانی پیدا می‌کند.